本報(bào)訊（記者趙秋麗、馮帆 通訊員王靜）日前，國(guó)際植物學(xué)領(lǐng)域著名期刊《自然—植物》在線發(fā)表了山東農(nóng)業(yè)大學(xué)張大健教授課題組在大豆基因組研究領(lǐng)域取得的新成果。該團(tuán)隊(duì)首次獲得了多年生野生大豆的高精度基因組圖譜，填補(bǔ)了大豆屬泛基因組的空白，解析了大豆進(jìn)化歷程，高效準(zhǔn)確挖掘了大豆基因組的結(jié)構(gòu)變異，拓寬了大豆分子育種可利用的基因資源，為大豆遺傳基礎(chǔ)解析、馴化性狀調(diào)控基因挖掘及種質(zhì)創(chuàng)新提供了重要的理論支撐。
大豆是重要的糧油、飼料兼用作物，在國(guó)民經(jīng)濟(jì)發(fā)展中具有重要的戰(zhàn)略地位。近年來，我國(guó)大豆進(jìn)口量持續(xù)增長(zhǎng)，對(duì)外依存度超過80%，嚴(yán)重威脅我國(guó)糧食安全，其種質(zhì)培育和改良工作迫在眉睫。
然而，從又黑又小的野生大豆到又黃又大的栽培大豆，這個(gè)過程中會(huì)丟失約70%的基因資源，張大健團(tuán)隊(duì)經(jīng)過多年科研攻關(guān)，最終找到了這一被視為選育大豆高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)新品種的有效基因靶點(diǎn)的關(guān)鍵“70%”。相比一年生野生大豆，多年生野生大豆具有遺傳多樣性豐富、抗病性強(qiáng)、耐旱、耐熱、耐鹽堿等優(yōu)勢(shì)。但由于多年生大豆基因組龐大、重復(fù)序列多和高度雜合等特性，一直缺乏高質(zhì)量染色體級(jí)別的參考基因組，更沒有泛基因組圖譜。
近年來，張大健團(tuán)隊(duì)在世界范圍內(nèi)選取了5個(gè)有代表性的二倍體多年生野生大豆品種和1個(gè)自然形成的異源四倍體多年生野生大豆進(jìn)行全基因組測(cè)序。綜合利用二代、三代、Hi-C等測(cè)序技術(shù)，組裝得到了染色體級(jí)別的高質(zhì)量參考基因組，首次構(gòu)建了多年生野生大豆泛基因組，并鑒定出109827個(gè)多年生大豆中的非冗余基因位點(diǎn)，發(fā)現(xiàn)其中約70%的基因位點(diǎn)在一年生大豆亞屬中丟失，為大豆育種提供了豐富的遺傳多樣性基礎(chǔ)。大豆遺傳育種學(xué)家孔凡江表示，這一研究不僅解析了大豆進(jìn)化歷程，而且高效準(zhǔn)確挖掘了大豆基因組的結(jié)構(gòu)變異，為大豆的遺傳基礎(chǔ)解析、馴化性狀調(diào)控基因挖掘及大豆種質(zhì)創(chuàng)新提供重要的數(shù)據(jù)支撐。
結(jié)合前期研究?jī)?nèi)容，針對(duì)已發(fā)掘的品質(zhì)和產(chǎn)量重要基因，張大健團(tuán)隊(duì)利用分子標(biāo)記輔助技術(shù)，已選育出適宜黃淮海地區(qū)種植的高產(chǎn)高油大豆品種。目前該品種已參加山東省大豆區(qū)域試驗(yàn)，表現(xiàn)良好。
山東農(nóng)業(yè)大學(xué)莊永斌副教授為該文的第一作者，山東農(nóng)業(yè)大學(xué)張大健教授和美國(guó)普渡大學(xué)馬漸新教授為該文的共同通訊作者。該研究獲得國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、山東省良種工程、泰山學(xué)者專家計(jì)劃、美國(guó)國(guó)家科學(xué)基金會(huì)植物基因組研究計(jì)劃等基金的共同資助。
(責(zé)編：王連香、楊迪)關(guān)鍵詞： 野生大豆
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