有人曾這樣形容：“掌握了一個(gè)生物保藏庫，就相當(dāng)于掌握了一大批工廠。”如今的中科院微生物研究所(以下簡(jiǎn)稱微生物所)，無疑就擁有這樣一個(gè)世界級(jí)的寶庫。

記者近日從微生物所獲悉，落戶在該所的國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心牽頭建設(shè)的全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺(tái)已經(jīng)匯聚了來自51個(gè)國家141家合作伙伴的52萬株微生物實(shí)物資源數(shù)據(jù)。“這說明作為全球最大的綜合性微生物研究機(jī)構(gòu)，微生物所正在國際合作中承擔(dān)更多責(zé)任。”微生物所所長(zhǎng)錢韋在接受《中國科學(xué)報(bào)》采訪時(shí)說。

“共享平臺(tái)使我國科學(xué)家能以全球視野組織、協(xié)調(diào)各國相關(guān)力量，建立全球性的合作框架。同時(shí)，也推動(dòng)著中國逐步在微生物資源的開發(fā)應(yīng)用和數(shù)據(jù)共享方面占據(jù)國際微生物研究前沿和主導(dǎo)地位。”全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺(tái)負(fù)責(zé)人、國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心主任馬俊才表示。

聚合資源 互聯(lián)互通

作為一家有著60年所齡的研究機(jī)構(gòu)，微生物所“家底”不少，其中之一就是傳承了幾代人的“微生物銀行”——中國普通微生物菌種保藏管理中心。

“這是國內(nèi)第一個(gè)通過國際標(biāo)準(zhǔn)化組織(ISO)認(rèn)證的保藏中心，也是全球最大的微生物資源庫之一。”錢韋介紹，該中心現(xiàn)保藏的實(shí)物菌種資源總量超過8萬株，已成為我國重要科學(xué)研究和微生物資源的寶庫。

家有梧桐樹，引得鳳凰來。2010年，經(jīng)過全球激烈競(jìng)爭(zhēng)，世界微生物數(shù)據(jù)中心落戶微生物所。11年來，全球共有77個(gè)國家的812個(gè)微生物資源保藏中心在該中心注冊(cè)，成為我國“盤點(diǎn)”全球微生物及其遺傳資源的重要平臺(tái)。

國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心是2019年20個(gè)首批啟動(dòng)的國家級(jí)科學(xué)數(shù)據(jù)中心之一，微生物所為牽頭單位，使我國微生物資源相關(guān)的一系列重要數(shù)據(jù)庫進(jìn)一步完善。

作為一名大數(shù)據(jù)研究領(lǐng)域的專業(yè)“選手”，彼時(shí)馬俊才同時(shí)肩挑世界和國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心負(fù)責(zé)人兩個(gè)職位。但他還有更大的決心——解決長(zhǎng)期以來全球微生物資源數(shù)據(jù)平臺(tái)存在的各國數(shù)據(jù)分散、用戶無法一站式檢索的問題。

于是，國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心和世界微生物數(shù)據(jù)中心牽頭建立了全球微生物菌種保藏目錄國際合作計(jì)劃，搭建了全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺(tái)，匯聚了來自51個(gè)國家141家合作伙伴的52萬株微生物實(shí)物資源數(shù)據(jù)，形成了全球互聯(lián)互通的微生物數(shù)據(jù)信息化合作網(wǎng)絡(luò)。

在錢韋看來，這個(gè)平臺(tái)就像一個(gè)“通天塔”，通過這個(gè)體系，中國可以組織和協(xié)調(diào)各國研究力量，建立全球性合作框架，在微生物資源整理整合和數(shù)據(jù)共享方面發(fā)揮引領(lǐng)和主導(dǎo)作用。

制定標(biāo)準(zhǔn) 引領(lǐng)國際

在近期舉行的2021年世界互聯(lián)網(wǎng)大會(huì)烏鎮(zhèn)峰會(huì)上，全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺(tái)入選首屆全球12項(xiàng)“攜手構(gòu)建網(wǎng)絡(luò)空間命運(yùn)共同體精品案例”。“這對(duì)我們是很大的鼓勵(lì)。”馬俊才認(rèn)為，所謂的“網(wǎng)絡(luò)空間命運(yùn)共同體”本質(zhì)是通過國際合作讓所有參與者都能從中受益。

據(jù)介紹，該共享平臺(tái)免費(fèi)開放，所有微生物數(shù)據(jù)向全世界共享。“相當(dāng)于全世界不同國家的微生物在一個(gè)統(tǒng)一的平臺(tái)上‘展銷’。”馬俊才說，它可以讓發(fā)展中國家的微生物保藏中心和資源更好地得到全球的關(guān)注，提高知名度;對(duì)于發(fā)達(dá)國家來說，它可以提供其評(píng)價(jià)體系中強(qiáng)調(diào)的微生物資源對(duì)全世界所作的貢獻(xiàn)。

馬俊才以歐洲最大的保藏中心——德國微生物菌種保藏中心的菌種在全球使用情況為例解釋道，數(shù)據(jù)平臺(tái)可以清晰顯示出1987年以來，全世界用戶用該中心的菌種發(fā)表了多少文章，從而了解該中心在全世界的影響力。

“這樣的系統(tǒng)評(píng)價(jià)報(bào)告現(xiàn)在由我們出，我們的數(shù)據(jù)庫具有權(quán)威性、完整性。”馬俊才說，“就像身份證一樣，凡是進(jìn)入全球微生物資源保藏中心注冊(cè)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的微生物資源，都有唯一編號(hào)和標(biāo)識(shí)符。”

為了打造高質(zhì)量國際性數(shù)據(jù)平臺(tái)，國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心聯(lián)合10多個(gè)國家相關(guān)領(lǐng)域的專家，共同制定了國際微生物資源領(lǐng)域的第一個(gè)ISO微生物資源數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)，消除了長(zhǎng)期以來由于各國微生物資源中心數(shù)據(jù)管理的形式不同帶來的共享阻礙。

不僅如此，國家微生物科學(xué)數(shù)據(jù)中心還啟動(dòng)了全球萬種微生物模式菌株測(cè)序計(jì)劃，目前已有16個(gè)國家的25個(gè)微生物保藏機(jī)構(gòu)參與到這一國際合作計(jì)劃中，并提供了DNA或菌株資源，這使全球數(shù)據(jù)資源共享真正發(fā)展成為國際微生物實(shí)物資源的合作。

目前全世界科學(xué)家已發(fā)表的模式細(xì)菌有17800種，其中已經(jīng)測(cè)序的僅有8000種，完成對(duì)其余模式細(xì)菌的測(cè)序正是研究團(tuán)隊(duì)的目標(biāo)。馬俊才透露，目前這一引領(lǐng)項(xiàng)目已完成4000多種模式微生物的測(cè)序。

虛實(shí)結(jié)合 打造高地

“我們既擁有世界的，也擁有國家的數(shù)據(jù)庫，這兩套體系是我們?cè)谖⑸镔Y源研究和對(duì)外合作交流方面的一個(gè)極大優(yōu)勢(shì)。”錢韋說。

談起對(duì)數(shù)據(jù)中心未來的期待，錢韋希望，它可以在數(shù)據(jù)科學(xué)的核心算法方面取得突破，解決相關(guān)的“卡脖子”問題;推進(jìn)虛擬數(shù)據(jù)與實(shí)物保藏的聯(lián)動(dòng)，打造微生物領(lǐng)域的“物聯(lián)網(wǎng)”，以數(shù)據(jù)帶動(dòng)知識(shí)體系和實(shí)物資源體系的發(fā)展;在微生物數(shù)據(jù)方面培養(yǎng)出世界級(jí)科學(xué)家。

“正是在中國政府、中科院和微生物所的大力支持下，數(shù)據(jù)中心才有今天的面貌。”馬俊才說，得益于這些支持，中心每年都會(huì)舉辦國際研討會(huì)、培訓(xùn)班，甚至還走出國門，把相關(guān)會(huì)議和培訓(xùn)延伸到了國外，在拓展國際合作中起到了很好的作用。

馬俊才表示，下一步，全球微生物資源數(shù)據(jù)共享平臺(tái)將進(jìn)一步吸引國際伙伴加入到這一合作網(wǎng)絡(luò)，構(gòu)建國際上最大、最權(quán)威的微生物識(shí)別平臺(tái);進(jìn)一步開展數(shù)據(jù)挖掘應(yīng)用，助力病原微生物防控決策，利用微生物支撐產(chǎn)業(yè)發(fā)展。他們還將繼續(xù)推進(jìn)萬種微生物模式菌株測(cè)序計(jì)劃，以完善和重構(gòu)生命系統(tǒng)發(fā)育樹，建立基于組學(xué)數(shù)據(jù)的微生物分類“金標(biāo)準(zhǔn)”。(記者 馮麗妃)

關(guān)鍵詞： 微生物科學(xué) 生物保藏庫 微生物所