科技日報記者 馬愛平 通訊員 歐陽燦彬 嚴(yán)芳
近日,中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所作物病原生物功能基因組研究創(chuàng)新團(tuán)隊利用基因組和轉(zhuǎn)錄組測序數(shù)據(jù),系統(tǒng)分析了團(tuán)隊開發(fā)的高效腺嘌呤堿基編輯器的脫靶效應(yīng),為提高堿基編輯特異性提供了新策略。相關(guān)研究成果發(fā)表在《基因組生物學(xué)》(Genome Biology)上。
(腺嘌呤堿基編輯器引起的DNA脫靶突變在水稻染色體上的分布圖)
腺嘌呤堿基編輯器是從CRISPR技術(shù)發(fā)展的在基因組指定位置上進(jìn)行編輯的編輯器,被廣泛應(yīng)用于動植物育種、基因治療和基礎(chǔ)科學(xué)研究中,而脫靶效應(yīng)是限制其應(yīng)用的關(guān)鍵因素。腺嘌呤堿基編輯器含有CRISPR和腺苷脫氨酶兩個重要組分四套重要元件。團(tuán)隊人員對利用四套腺嘌呤堿基編輯器創(chuàng)制的水稻植株進(jìn)行了全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序并進(jìn)行了脫靶效應(yīng)評估。這一研究成果也為腺嘌呤堿基編輯器的優(yōu)化指明了新方向。
該研究得到國家自然科學(xué)基金、中央公益性科研機(jī)構(gòu)基礎(chǔ)研究基金項目資助。
(中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護(hù)研究所供圖)
關(guān)鍵詞: 嘌呤堿基