通訊員 左彥 科技日報記者 代小佩
3月17日，首都醫(yī)科大學附屬北京世紀壇醫(yī)院胃腸肝膽腫瘤外科彭吉潤教授課題組和北京大學生物醫(yī)學前沿創(chuàng)新中心張澤民教授課題組合作，在國際期刊《腫瘤細胞》（Cancer Cell）上在線發(fā)表研究論文，解析了腫瘤免疫微環(huán)境形成因素。
腫瘤微環(huán)境特征與免疫檢查點抑制劑的治療效果密切相關，系統(tǒng)解析腫瘤微環(huán)境中不同免疫細胞的表型，是理解腫瘤發(fā)生、發(fā)展機理以及提高免疫治療效果的關鍵。上述研究以結直腸癌肝轉移為模型，利用單細胞轉錄組測序技術系統(tǒng)研究了腫瘤微環(huán)境如何形成這一問題，并給出了新認識、新見解。
該研究中，課題組收集了一組未經(jīng)治療的結直腸癌肝轉移患者包括原發(fā)腸癌及癌旁組織、肝轉移癌及癌旁組織、腸系膜淋巴結和外周血在內(nèi)的配對樣本，對32萬3千多個細胞進行了10x Genomics測序，同時還對5000多個細胞采用Smart-seq 2方法進行了測序驗證。通過整合多種scRNA-seq平臺的表達譜數(shù)據(jù)和T細胞受體序列測序結果，研究人員構建了結直腸癌肝轉移患者多種組織的高分辨率免疫細胞轉錄組圖譜，并為后續(xù)相關研究工作提供了極有價值的數(shù)據(jù)資源。
為了量化分析腫瘤細胞成分和駐留組織/器官生境對各種免疫細胞不同表型的影響，研究人員設計了一種被稱為PhenoAligner的算法，表型顯著受到惡性腫瘤細胞影響的免疫類群被定義為M-type，而表型顯著受到組織/器官生境影響的免疫類群則被定義為N-type。研究人員還識別出多種與腫瘤進展或轉移相關的關鍵性免疫細胞。此外，研究人員鑒定出三群分別高表達SPP1、C1QC和MKI67的腫瘤相關巨噬細胞。
關鍵詞： 腫瘤免疫
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